시즌6이 시즌5와 가장 크게 다른 점을 몇 가지로 요약해 보자면 일단, 닥터의 동행자, 에이미가 남자 친구인 로리와 결혼을 하면서 로리까지 시간 여행의 고정 멤버로 출연한다는 점이다. 동행자의 남편이 고정 멤버로 편승하면서 닥터와 동행자의 관계가 더 이상은 연인 관계 같은 핑크빛 무드일 수는 없게 된 것. 어찌 보면 닥터와 동행자 사이의 설레고 아슬아슬한 로맨스가 없어진 것 같아 김이 샐 수도 있지만 11화 The God Complex에서 분명히 보여주듯이 닥터는 에이미의 연인이 아니라 신으로 승격됐다는 걸 알 수 있다.

시즌6의 두 번째 특징으론 13개의 에피소드가 봄(1-7편)과 가을(8-13편)로 나뉘어져 방송이 됐다는 점이다. BBC의 공식 발표에 의하면 앞으로 나올 시즌은 모두 이런 식으로 방영할 예정이라고 하는데, 이런 방송 일정의 변화는 프로듀서이자 수석 작가인 스티브 모펫의 요청에 의한 것이며, 그 이유는 시리즈 중간에 커다란 줄거리의 반전이 있기 때문이라고 한다. 이렇게 시리즈를 나누는 모펫의 계획은 닥터후의 내용에 더 많은 긴장감을 부여하고 줄거리의 반전에 대해 시청자들의 흥미를 돋우기 위함일 뿐만 아니라 가을까지 계속 그들의 궁금증을 붙잡아 두려는 의도 또한 숨어있다.

과거의 시즌들이 독립적인 이야기들로 구성된 각각의 어드벤처였다면 시즌5와 시즌6에 들어서서 소개되는 에피소드들은 모두가 마지막 편과 긴밀하게 연결되는 단서의 연속들이라고 볼 수 있다. 그렇기 때문에 중간에 흐름을 끊는 것이 오히려 이야기의 긴장감을 높이는 효과를 가져 올 수 있었던 것이다.

시즌6에선 맷 스미스 닥터의 개성이 시즌5에서보다 훨씬 강하게 드러난다. 맷 스미스 닥터는 데이비드 테넌트 닥터를 모든 면에서 뒤집는다. 정신없는 수다로 적을 무력화 시키는 닥터 특유의 매너는 여전히 살아있지만 시즌5에서부터 복선으로 나왔던 ‘Silence will fall.'이란 말의 수수께끼가 결국엔 닥터의 입을 막겠다는 뜻으로 판명되면서 닥터의 무기력감은 점점 증폭된다. 이전의 닥터가 지구를 구하고, 인류를 구하고, 영국과 여왕을 구하는 구원자였다면 맷 닥터는 로즈, 마사, 도나의 인생을 망쳤다고 자책하는, 그래서 죽어가는 시간을 살리기 위해 자신의 종말을 순순히 받아들이는 순교자로 비쳐진다. 하지만 죽음의 순간, 닥터의 순교를 막는 여인이 있으니, 바로 시즌4부터 얼굴을 비치기 시작했던 닥터 리버 송! 닥터의 아내일지도 모른다는 여운만을 남긴 채 홀연히 나타났다가 사라지기를 반복하던 리버 송이 마침내 베일을 완전히 벗고 그 정체를 드러낸다. 여기엔 에이미와 로리의 결혼이 연관돼 있고 이 부부가 타디스 안에서 첫날밤을 보낸 후 잉태한 허니문 베이비가 관련이 되어 있다. 아멜리아 폰드와 리버 송이라는 이름이 갖는 특별한 의미 또한 이번 시즌에서 꼭 풀어야 할 수수께끼다.

- 방영편수 : 13화